MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti Rm41

Total Repeats: 76300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018700	GC	3	6	109	114	0 %	0 %	50 %	50 %	407719210
2	NC_018700	GGTC	2	8	126	133	0 %	25 %	50 %	25 %	407719210
3	NC_018700	CGT	2	6	189	194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719210
4	NC_018700	CGA	2	6	209	214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719210
5	NC_018700	AAT	2	6	235	240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407719210
6	NC_018700	CAC	2	6	258	263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719210
7	NC_018700	CAG	2	6	271	276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719210
8	NC_018700	AG	3	6	351	356	50 %	0 %	50 %	0 %	407719210
9	NC_018700	GCG	2	6	376	381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719210
10	NC_018700	GTC	2	6	382	387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719210
11	NC_018700	CCTC	2	8	388	395	0 %	25 %	0 %	75 %	407719210
12	NC_018700	CCG	2	6	396	401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719210
13	NC_018700	CGG	2	6	404	409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719210
14	NC_018700	GCC	2	6	427	432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719210
15	NC_018700	CGC	2	6	485	490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719210
16	NC_018700	TCG	2	6	529	534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719210
17	NC_018700	GCCGGC	2	12	574	585	0 %	0 %	50 %	50 %	407719210
18	NC_018700	TCT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719210
19	NC_018700	GC	5	10	679	688	0 %	0 %	50 %	50 %	407719210
20	NC_018700	CGT	2	6	693	698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719210
21	NC_018700	CGA	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719210
22	NC_018700	TGC	2	6	866	871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719210
23	NC_018700	GGT	2	6	888	893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719210
24	NC_018700	CGC	2	6	897	902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719210
25	NC_018700	TCGC	2	8	945	952	0 %	25 %	25 %	50 %	407719210
26	NC_018700	GGC	2	6	961	966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719210
27	NC_018700	CGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719210
28	NC_018700	GCG	2	6	1033	1038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719210
29	NC_018700	CTCG	2	8	1053	1060	0 %	25 %	25 %	50 %	407719210
30	NC_018700	CAGC	2	8	1103	1110	25 %	0 %	25 %	50 %	407719210
31	NC_018700	CCG	2	6	1149	1154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719210
32	NC_018700	TCGA	2	8	1174	1181	25 %	25 %	25 %	25 %	407719210
33	NC_018700	CGA	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719210
34	NC_018700	CCGCG	2	10	1225	1234	0 %	0 %	40 %	60 %	407719210
35	NC_018700	CGT	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719210
36	NC_018700	CCG	2	6	1305	1310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719210
37	NC_018700	GCC	2	6	1391	1396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719210
38	NC_018700	CGG	2	6	1401	1406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719210
39	NC_018700	AGG	3	9	1697	1705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719211
40	NC_018700	CG	3	6	1776	1781	0 %	0 %	50 %	50 %	407719211
41	NC_018700	CGA	2	6	1790	1795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719211
42	NC_018700	CGG	3	9	1796	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719211
43	NC_018700	CG	4	8	1926	1933	0 %	0 %	50 %	50 %	407719211
44	NC_018700	GATC	2	8	2030	2037	25 %	25 %	25 %	25 %	407719212
45	NC_018700	CG	3	6	2051	2056	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
46	NC_018700	GCT	2	6	2075	2080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719212
47	NC_018700	GGA	2	6	2108	2113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719212
48	NC_018700	AGG	2	6	2122	2127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719212
49	NC_018700	CCG	2	6	2166	2171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719212
50	NC_018700	CG	3	6	2170	2175	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
51	NC_018700	CGC	2	6	2180	2185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719212
52	NC_018700	TCG	2	6	2197	2202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719212
53	NC_018700	GCG	2	6	2228	2233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719212
54	NC_018700	CG	3	6	2239	2244	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
55	NC_018700	GCC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719212
56	NC_018700	GGA	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719212
57	NC_018700	CGA	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
58	NC_018700	CGA	2	6	2333	2338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
59	NC_018700	GCT	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719212
60	NC_018700	GCA	2	6	2362	2367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
61	NC_018700	CAG	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
62	NC_018700	GCG	2	6	2466	2471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719212
63	NC_018700	AGC	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
64	NC_018700	GCC	2	6	2511	2516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719212
65	NC_018700	CGA	2	6	2575	2580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
66	NC_018700	CCG	2	6	2638	2643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719212
67	NC_018700	CGA	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
68	NC_018700	GCT	3	9	2675	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719212
69	NC_018700	CCG	2	6	2695	2700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719212
70	NC_018700	ATG	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719212
71	NC_018700	CTG	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719212
72	NC_018700	CG	3	6	2746	2751	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
73	NC_018700	CG	4	8	2754	2761	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
74	NC_018700	CGT	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719212
75	NC_018700	CGG	2	6	2805	2810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719212
76	NC_018700	GCCG	2	8	2818	2825	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
77	NC_018700	GAT	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719212
78	NC_018700	CGC	2	6	2871	2876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719212
79	NC_018700	GCA	2	6	2898	2903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
80	NC_018700	GAG	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719212
81	NC_018700	CCT	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719212
82	NC_018700	GTC	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719212
83	NC_018700	CG	3	6	3018	3023	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
84	NC_018700	TGG	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719212
85	NC_018700	TAT	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407719212
86	NC_018700	GCG	2	6	3121	3126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719212
87	NC_018700	AGC	2	6	3136	3141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719212
88	NC_018700	GC	3	6	3159	3164	0 %	0 %	50 %	50 %	407719212
89	NC_018700	CCA	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719212
90	NC_018700	GAA	3	9	3267	3275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719212
91	NC_018700	CGAC	2	8	3369	3376	25 %	0 %	25 %	50 %	407719213
92	NC_018700	CGG	2	6	3385	3390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719213
93	NC_018700	CG	3	6	3429	3434	0 %	0 %	50 %	50 %	407719213
94	NC_018700	CTC	2	6	3486	3491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719213
95	NC_018700	GGGC	2	8	3528	3535	0 %	0 %	75 %	25 %	407719213
96	NC_018700	TCG	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719213
97	NC_018700	CGG	2	6	3681	3686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719213
98	NC_018700	GGC	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719213
99	NC_018700	CG	3	6	3731	3736	0 %	0 %	50 %	50 %	407719213
100	NC_018700	GAG	2	6	3899	3904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719214
101	NC_018700	GCC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719214
102	NC_018700	CACGG	2	10	3962	3971	20 %	0 %	40 %	40 %	407719214
103	NC_018700	C	7	7	3998	4004	0 %	0 %	0 %	100 %	407719214
104	NC_018700	CGG	2	6	4027	4032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719214
105	NC_018700	GAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719214
106	NC_018700	GCG	2	6	4104	4109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719214
107	NC_018700	GGC	2	6	4168	4173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719214
108	NC_018700	GGC	2	6	4276	4281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719214
109	NC_018700	GATC	2	8	4282	4289	25 %	25 %	25 %	25 %	407719214
110	NC_018700	CGCC	2	8	4328	4335	0 %	0 %	25 %	75 %	407719214
111	NC_018700	GGA	2	6	4366	4371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719214
112	NC_018700	GCG	3	9	4379	4387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719214
113	NC_018700	AGG	3	9	4416	4424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407719214
114	NC_018700	GGC	2	6	4481	4486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719214
115	NC_018700	GCC	2	6	4534	4539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719214
116	NC_018700	TGC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719214
117	NC_018700	TCG	3	9	4560	4568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719214
118	NC_018700	ACG	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719214
119	NC_018700	TGG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407719214
120	NC_018700	TCG	2	6	4695	4700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719214
121	NC_018700	GAAG	2	8	4708	4715	50 %	0 %	50 %	0 %	407719214
122	NC_018700	CAG	2	6	4741	4746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719215
123	NC_018700	CCA	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407719215
124	NC_018700	CGG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719215
125	NC_018700	GCAGC	2	10	4794	4803	20 %	0 %	40 %	40 %	407719215
126	NC_018700	TTC	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719215
127	NC_018700	CCGGAT	2	12	4859	4870	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407719215
128	NC_018700	CGC	2	6	4991	4996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719215
129	NC_018700	GCC	2	6	5072	5077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719215
130	NC_018700	CCGG	2	8	5150	5157	0 %	0 %	50 %	50 %	407719215
131	NC_018700	CCG	2	6	5228	5233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719215
132	NC_018700	ACG	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719215
133	NC_018700	GAT	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719215
134	NC_018700	CCT	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719215
135	NC_018700	GCTCCC	2	12	5357	5368	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	407719215
136	NC_018700	CG	4	8	5432	5439	0 %	0 %	50 %	50 %	407719215
137	NC_018700	CGAG	2	8	5522	5529	25 %	0 %	50 %	25 %	407719215
138	NC_018700	GCCG	2	8	5541	5548	0 %	0 %	50 %	50 %	407719215
139	NC_018700	GC	4	8	5735	5742	0 %	0 %	50 %	50 %	407719215
140	NC_018700	GCG	2	6	5767	5772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719215
141	NC_018700	CGC	2	6	5838	5843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719215
142	NC_018700	GCGCGG	2	12	5970	5981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719216
143	NC_018700	TCC	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719216
144	NC_018700	CG	3	6	6103	6108	0 %	0 %	50 %	50 %	407719216
145	NC_018700	GAC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719216
146	NC_018700	CGC	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719216
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149	NC_018700	CGA	2	6	6451	6456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719216
150	NC_018700	CGA	3	9	6544	6552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719216
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152	NC_018700	GCCG	2	8	6653	6660	0 %	0 %	50 %	50 %	407719217
153	NC_018700	GCC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719217
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155	NC_018700	GGC	2	6	6837	6842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719217
156	NC_018700	CGC	2	6	6883	6888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719217
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158	NC_018700	GGC	2	6	6904	6909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719217
159	NC_018700	GGCCTC	2	12	6956	6967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407719217
160	NC_018700	CGA	2	6	7287	7292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719218
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162	NC_018700	TTC	3	9	7336	7344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719218
163	NC_018700	CCG	2	6	7362	7367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719218
164	NC_018700	GCC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719218
165	NC_018700	TCA	2	6	7401	7406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719218
166	NC_018700	GGC	2	6	7492	7497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719218
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168	NC_018700	TCCA	2	8	7544	7551	25 %	25 %	0 %	50 %	407719218
169	NC_018700	GCC	2	6	7606	7611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719218
170	NC_018700	TCGA	2	8	7634	7641	25 %	25 %	25 %	25 %	407719218
171	NC_018700	CGA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719218
172	NC_018700	TGCG	2	8	7715	7722	0 %	25 %	50 %	25 %	407719218
173	NC_018700	CGC	2	6	7741	7746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719218
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176	NC_018700	TCC	2	6	7844	7849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719218
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179	NC_018700	TC	3	6	8357	8362	0 %	50 %	0 %	50 %	407719219
180	NC_018700	TGA	2	6	8407	8412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719219
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182	NC_018700	GCCG	2	8	8457	8464	0 %	0 %	50 %	50 %	407719219
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242	NC_018700	TGAT	2	8	12101	12108	25 %	50 %	25 %	0 %	407719223
243	NC_018700	CCG	2	6	12162	12167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719223
244	NC_018700	GAA	2	6	12184	12189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719223
245	NC_018700	CG	3	6	12210	12215	0 %	0 %	50 %	50 %	407719223
246	NC_018700	TTG	2	6	12230	12235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407719223
247	NC_018700	CGA	2	6	12282	12287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719223
248	NC_018700	CTG	2	6	12340	12345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719223
249	NC_018700	TCGC	2	8	12356	12363	0 %	25 %	25 %	50 %	407719223
250	NC_018700	GC	3	6	12383	12388	0 %	0 %	50 %	50 %	407719223
251	NC_018700	CGC	2	6	12450	12455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719223
252	NC_018700	TTC	2	6	12458	12463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719223
253	NC_018700	GGGCA	2	10	12514	12523	20 %	0 %	60 %	20 %	407719223
254	NC_018700	CAA	2	6	12537	12542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407719223
255	NC_018700	GCC	2	6	12547	12552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719223
256	NC_018700	GCG	2	6	12560	12565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719223
257	NC_018700	ACG	3	9	12569	12577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719223
258	NC_018700	ATG	2	6	12584	12589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719223
259	NC_018700	AC	3	6	12597	12602	50 %	0 %	0 %	50 %	407719223
260	NC_018700	TCG	2	6	12674	12679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719223
261	NC_018700	CGC	2	6	12681	12686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719223
262	NC_018700	TCT	2	6	12690	12695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407719223
263	NC_018700	GC	3	6	12776	12781	0 %	0 %	50 %	50 %	407719223
264	NC_018700	GC	3	6	12811	12816	0 %	0 %	50 %	50 %	407719223
265	NC_018700	CGG	2	6	12826	12831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719223
266	NC_018700	CTG	2	6	12838	12843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719223
267	NC_018700	GCA	2	6	12852	12857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719223
268	NC_018700	CG	3	6	12858	12863	0 %	0 %	50 %	50 %	407719223
269	NC_018700	CAT	2	6	12930	12935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407719223
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271	NC_018700	GCC	2	6	13033	13038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719223
272	NC_018700	TCG	2	6	13046	13051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719223
273	NC_018700	CCGC	2	8	13119	13126	0 %	0 %	25 %	75 %	407719223
274	NC_018700	GCG	2	6	13128	13133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719223
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288	NC_018700	TGA	2	6	13798	13803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407719224
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298	NC_018700	CCT	2	6	14113	14118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407719224
299	NC_018700	GC	3	6	14141	14146	0 %	0 %	50 %	50 %	407719224
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376	NC_018700	GCCT	2	8	17953	17960	0 %	25 %	25 %	50 %	407719229
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378	NC_018700	CGC	2	6	18023	18028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719230
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380	NC_018700	GC	3	6	18072	18077	0 %	0 %	50 %	50 %	407719230
381	NC_018700	CGA	2	6	18086	18091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407719230
382	NC_018700	CGAGC	2	10	18096	18105	20 %	0 %	40 %	40 %	407719230
383	NC_018700	GCC	2	6	18117	18122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719230
384	NC_018700	CGT	2	6	18137	18142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407719230
385	NC_018700	GCC	2	6	18189	18194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407719230
386	NC_018700	G	6	6	18249	18254	0 %	0 %	100 %	0 %	407719230
387	NC_018700	GATCTT	2	12	18306	18317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407719230
388	NC_018700	TCGG	2	8	18334	18341	0 %	25 %	50 %	25 %	407719230
389	NC_018700	GAA	2	6	18657	18662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407719231
390	NC_018700	CGG	2	6	18674	18679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407719231
391	NC_018700	GC	3	6	18700	18705	0 %	0 %	50 %	50 %	407719231
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500	NC_018700	GC	3	6	23030	23035	0 %	0 %	50 %	50 %	407719234

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